Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEMP2A6NFY4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEMP2A6NFY4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEMP2A6NFY4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEMP2A6NFY4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEMP2A6NFY4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEMP2A6NFY4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEMP2A6NFY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEMP2A6NFY4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEMP2A6NFY4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEMP2A6NFY4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEMP2A6NFY4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms