Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6BA6NDN3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms