Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTAGE9A4FU28 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms