Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCHNA4D1U4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms