Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TARSL2A2RTX5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TARSL2A2RTX5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TARSL2A2RTX5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TARSL2A2RTX5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TARSL2A2RTX5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TARSL2A2RTX5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TARSL2A2RTX5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TARSL2A2RTX5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TARSL2A2RTX5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TARSL2A2RTX5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TARSL2A2RTX5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TARSL2A2RTX5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms