Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms