Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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TCRBV5S2A0A599 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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TCRBV5S2A0A599 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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TCRBV5S2A0A599 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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TCRBV5S2A0A599 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S2A0A599 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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