Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GTW7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms