Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms