Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV4-1A0A0J9YWV2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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