Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YVX5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms