Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP1Q9UPQ3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms