Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms