Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms