Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf88Q9BSF0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms