Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms