Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLHC1Q8NHS4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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