Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAAF3Q8N9W5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms