Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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