Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms