Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L6Q3SYB3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms