Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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