Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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