Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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