Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms