Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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