Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIXQ14938 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms