Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms