Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA7Q13683 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA7Q13683 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA7Q13683 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA7Q13683 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA7Q13683 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA7Q13683 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA7Q13683 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA7Q13683 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA7Q13683 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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