Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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