Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME3Q13232 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME3Q13232 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME3Q13232 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms