Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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