Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A2Q12908 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms