Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL096677.1-201ENST00000442884 814 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LINC00520-206ENST00000560336 883 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms