Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms