Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms