Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms