Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSE1LP55060 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms