Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBX2P40425 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBX2P40425 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms