Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA3P35244 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA3P35244 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms