Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM58BPP0C7Q3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM58BPP0C7Q3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM58BPP0C7Q3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM58BPP0C7Q3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM58BPP0C7Q3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM58BPP0C7Q3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM58BPP0C7Q3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM58BPP0C7Q3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM58BPP0C7Q3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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