Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB3O43889 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms