Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms