Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCAO15360 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCAO15360 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCAO15360 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCAO15360 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms