Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms