Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM3A6NNA2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms