Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8JA6NMD2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms