Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms