Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms