Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS4Q9NRS4 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms